Во время раскопок городища Херсонес 1897 года исследователями был обнаружен храм, в последствии получивший название "Храм с ковчегом". Такое название памятнику было дано, в связи с тем, что в тайнике под алтарем был найден небольшой серебряный ковчег (ларец) с мощами. Херсонесский ковчег с 1900 года хранится в Санкт-Петербургском Эрмитаже.Мощи из ковчега были переданы в Херсонесский монастырь.
Один из самых известных археологических памятников христианского Херсонеса — небольшой серебряный ковчег (11x13x8,5 см), украшенный гравированными изображениями Христа, а также апостолов Петра и Павла на одной стороне, Девы Марии и двух архангелов на другой. На торцах находились изображения еще двух святых, вероятно, Сергия и Вакхапо — юных святых ( возможно, Георгий и Димитрий). Крышку украшали четыре креста. Сохранившаяся монограмма указывает на византийского императора Юстиниана I (527-565 года н. э.). В ковчеге хранились мощи святого — предполагают, что Сергия. Интересно, однако, что в сирийской Русафе, на месте гибели св. Сергия, имеется полный комплект его костей... Искусствоведы датируют этот ковчег-реликварий серединой VI века.
Вероятно, ковчег был подарен херсонеситам византийским императором, который уделял большое внимание укреплению христианства, как из-за собственного благочестия, так и прекрасно понимая роль церкви в деле пропаганды имперских идеалов.
Вот как описывает К.К. Косцюшко-Валюжинич открытие в 1897 году тайника под алтарем, в котором был найден ковчег:
... по середине фундамента, по направлению оси храма, была обнаружена гробничка, старательно сложенная из черепиц, положенных в 3 ряда на извести, и закрытая мраморной плитой, сверху которой находился бетон, служивший основанием для мраморного пола алтаря. Только благодаря столь прочному покрытию гробнички, последняя уцелела от всех бедствий, постигших храм ... На мраморной дощечке, на которой стоял ковчег, лежали отпавшие от него серебряные приборы: крючочек с застежкой и две завесы от крышки, а также остатки истлевшей ткани, в которую был завернут ковчег. Приглашенный на место раскопок настоятель монастыря, архимандрит Александр, открыл в присутствии духовенства, заведующего раскопками г. Косцюшко-Валюжинича и рабочих, ковчег, внутри которого оказались завернутые в истлевшую шелковую ткань частицы мощей, которые с подобающей торжественностью были перенесены в новый храм Св. Владимира. Частицы мощей состояли из косточек, по-видимому, от пальцев, и по объяснению о. архимандрита, почернели от огня, так что вероятно, принадлежат неизвестному, пока, святому мученику за христианскую проповедь, погибшему на костре.
В отчете Карла Косцюшко-Валюжинича особенно подчеркнуто - "пока неизвестному". Да, и по сей день этот вопрос остается до конца невыясненным.
